（一）真菌荧光染色镜检项目。通过特殊的荧光素与真菌细胞壁的几丁质和纤维素相结合在荧光显微镜下发出荧光检测真菌成分，较传统真菌检测具有高特异性、高敏感性的优点，极大降低了传统真菌直接镜检的误检、漏检率，为临床真菌感染疾病诊治提供了更精准的诊断依据。临床适应症包括浅表及深部真菌感染，标本类型包括皮屑、甲屑、毛发、脓液，分泌物、痰液，尿液等各种标本。
（二）细菌培养鉴定及药敏。实验室现有VITEK2-compact细菌鉴定及药敏分析仪一台，可对各类细菌进行鉴定以及药敏试验，使用自动化仪器和纸片扩散法等为临床提供药敏数据。
（三）病原体分子鉴定项目。在传统镜检及培养项目的基础上，增设快速、精准的分子检测技术，有效弥补传统病原体培养周期长的不足，检测时间可缩短至数小时。基于PCR的检测技术可早期、快速、敏感、特异性检测侵入体内的外源性基因，不仅可以对微生物感染进行准确的病因学诊断，还可对感染性病原体进行基因分型。本科室开展分枝杆菌（麻风分枝杆菌、结核分枝杆菌、非结核分枝杆菌）qPCR检测、淋球菌DNA检测、支原体DNA检测、衣原体DNA检测、梅毒分泌物/血液DNA检测和乙肝病毒定量检测。同时可利用一代测序等技术对罕见病原体进行测序鉴定，实现更精准的病因学诊断。
